1958年11月,卫生部委托云南省卫生厅在西双版纳建立的热带药用植物研究基地,由思茅地区药材公司负责筹建。
1959年4月,与省卫生厅药政局正式合办“景洪药用植物试验站”,属中国医学科学院和云南省卫生厅共同管理。
1973年,景洪药物试验站划归省卫生厅领导。
1978年,经卫生部报国务院批准,景洪药物试验站仍收归卫生部医科院药物所统一领导。
1983年,成立“中国医学科学院药用植物资源开发研究所”卫生部又将景洪药物试验站升格为该研究所的分所,称“中国医学科学院药用植物资源开发研究所云南分所”。
1995年,更名为“中国医学科学院药用植物研究所云南分所 。